A classificação das samambaias era altamente instável no passado, principalmente porque os caracteres morfológicos selecionados para ênfase nas classificações de nível superior eram variáveis. Christenhusz e Chase revisam a história da classificação de samambaias e consideram que algumas classificações baseadas em características únicas foram úteis para identificar espécies, mas são altamente artificiais em termos de suas visões sobre relacionamentos, enquanto classificações usando um conjunto de caracteres foram consideradas mais "naturais", mas com o avanço da filogenética molecular, muitos desses grupos "naturais" também se mostraram altamente artificiais. Eles destacam quais grupos/gêneros têm questões taxonômicas que ainda precisam ser esclarecidas e propõem o uso de conceitos de família mais amplos. O progresso no desenvolvimento de uma classificação consensual de samambaias é refletido em uma nova classificação proposta.