Ciência Compartilhada: 3 de outubro

Nesta semana, boa parte da seleção é do bioRxiv, então o acesso é gratuito. Embora não tenham sido revisados ​​por pares, presumo que, se muitas pessoas estão compartilhando um pré-print, é porque há algo de interessante nele. Como de costume, os artigos pagos estão marcados com um 💰; caso contrário, o acesso é gratuito no momento da verificação.

1. NO VEIN é uma proteína ancestral de imunidade envolvida na interação planta-vírus.
Lågeide, E. e outros. bioRxiv · 2 publicações · 83 curtidas · 48 republicações em Bluesky

Neste estudo, demonstramos que a proteína vegetal NO VEIN (NOV), previamente caracterizada por suas funções essenciais no desenvolvimento de Arabidopsis thaliana, compartilha composição de domínios e similaridade estrutural com a Tiamat, uma proteína antifágica bacteriana.

2. Evolução gradual das funções de desenvolvimento e simbióticas de DELLA em plantas terrestres.
Melkonian, K. e outros. New Phytologist · 2 publicações · 44 curtidas · 33 republicações em Bluesky

Em plantas com flores, as proteínas DELLA (nomeadas a partir de um motivo conservado de aminoácidos contendo Aspartato (D), Glutamato (E), Leucina (L) e Alanina (A)) são fatores de transcrição GIBBERELLIN INSENSITIVE, REPRESSOR OF GA1-3 e SCARECROW (GRAS) e desempenham múltiplas funções mediadas pelo hormônio vegetal giberelina (GA).

3. Divergência na tolerância à murcha em toda a área de distribuição de Mimulus guttatus na ausência de regulação estomática.
Ramo, HA e outros. bioRxiv · 4 publicações · 56 curtidas · 18 republicações em Bluesky

A capacidade de fenótipos e ambientes predizerem o desempenho sob estresse é fundamental para a ecologia e a evolução, podendo revelar a vulnerabilidade das espécies às mudanças climáticas globais. Amostramos Mimulus guttatus em toda a sua área de distribuição para testar se características reprodutivas, morfológicas e fisiológicas predizem respostas à seca. Surpreendentemente, descobrimos que a resposta estomática, um importante mediador do balanço hídrico, não se alterou com a intensificação da seca.

4. O direcionamento do receptor SRF3 da superfície celular da cevada pelo Blumeria hordei efetor AVR_A13 sobreposições com AVR_A13 reconhecimento por MLA e indução da morte celular mediada por NLR.
Shi, W. e outros. bioRxiv · 1 publicação · 26 curtidas · 15 republicações em Bluesky

Os patógenos secretam proteínas efetoras para promover a virulência. Apesar de serem reconhecidos pelos genes de resistência Mla da cevada, os efetores AVR a de Blumeria hordei (Bh), estruturalmente relacionados, são mantidos no genoma de Bh, sugerindo funções de virulência críticas para a patogenicidade fúngica. Usando marcação de proteínas dependente de proximidade em cevada transgênica, detectamos interactomas distintos de proteínas hospedeiras para cinco AVR As, apesar de sua homologia estrutural e convergência em MLAs. Relatamos a interação específica do efetor AVR A13, altamente conservado, com o receptor de superfície celular da cevada, SRF3. O AVR A13 interrompe a interação HvSRF3-HvBAK1 e altera os níveis de HvSRF3 na membrana plasmática.

Isabel Saur @izzysaurlab.bsky.social · no Bluesky

É com grande satisfação que apresentamos uma importante atualização do nosso manuscrito: www.biorxiv.org/content/10.6...
Em colaboração com @grandpahiro.bsky.social,
@sara-stolze.bsky.social, Matthieu Platre e as equipes de Götz Hensel e Gunther Döhlemann demonstramos que….. (1/x)

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5. Vinculando a variação genômica à adaptação de características florais em diferentes espécies.
Acoca‐Pidolle, S., Wessinger, CA, Hileman, LC · New Phytologist · 2 publicações · 21 curtidas · 15 republicações em Bluesky

Nesta revisão, adotamos uma perspectiva de genética quantitativa e questionamos se e como a arquitetura genética da divergência de características florais depende da adaptação a sistemas de polinização específicos e como ela fornece informações sobre a dinâmica da formação de características florais durante a divergência. Após revisar os resultados de estudos que mapeiam características florais divergentes em espécies intimamente relacionadas, enfatizamos a importância de combinar abordagens de mapeamento de características com abordagens que identificam a variação genômica que diferencia os limites das espécies.

New Phytologist @newphyt.bsky.social · no Bluesky

Vinculando a variação genômica à adaptação de características florais em diferentes espécies.

#TansleyReview por Acoca-Pidolle et al. @carriewessi.bsky.social

nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/...

#ciênciadasplantas

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6. Oligômero sintético do receptor FLS2 aumenta a imunidade inata das plantas.
Ma, Z. e outros. Os avanços da ciência · 1 publicação · 23 curtidas · 14 republicações em Bluesky

A montagem e oligomerização graduais de receptores da superfície celular são cruciais para a regulação da ativação e renovação imunológica. No entanto, como a montagem dinâmica e regulada espacial e temporalmente permite a sinalização rápida e sustentada na imunidade inata das plantas permanece incerto, devido à complexidade inerente às suas associações dinâmicas. Utilizando uma abordagem de engenharia sintética, controlamos com precisão os estados de oligomerização do receptor FLS2 de Arabidopsis.

7. O fungo da brusone do arroz sequestra um peptídeo RALF do arroz para iniciar a infecção.
Fukada, F. e outros. bioRxiv · 1 publicação · 22 curtidas · 13 republicações em Bluesky

Peptídeos derivados de plantas regulam a imunidade e as interações hospedeiro-micróbio, mas se patógenos fúngicos exploram peptídeos endógenos de plantas para a seleção do local de infecção permanece em grande parte desconhecido. Os fatores de alcalinização rápida (RALFs) são uma família de hormônios peptídicos vegetais que contribuem para o desenvolvimento, reprodução, respostas ao estresse e organização da parede celular das plantas. Aqui, mostramos que o OsRALF7, um peptídeo imunoativador em arroz (Oryza sativa), é cooptado pelo fungo da brusone do arroz, Magnaporthe oryzae, como um sinal derivado do hospedeiro para a formação de apressórios, estruturas de infecção especializadas necessárias para a penetração no hospedeiro. Enquanto o peptídeo sintético OsRALF7 induziu respostas de defesa em células de suspensão de arroz, o mesmo peptídeo induziu a formação de apressórios em M. oryzae.

8. Identificação, faseamento e anotação estrutural de cromossomos sexuais para montagens de genomas usando o CBS-tools.
Whitt, L. e outros. bioRxiv · 1 publicação · 20 curtidas · 12 republicações em Bluesky

Um genoma de referência completo para espécies com sexos separados e determinados cromossomicamente deve conter scaffolds para todos os homólogos dos cromossomos sexuais. No entanto, os cromossomos sexuais apresentam desafios computacionais distintos em comparação aos autossomos. Aqui, apresentamos uma análise baseada em k-mers que utiliza o sequenciamento de genomas completos de alguns isolados com sexo identificado: as ferramentas de Citogenética por Sequenciamento (CBS). Ao contrário de outras abordagens que normalmente abordam apenas um aspecto dos cromossomos sexuais, as ferramentas CBS buscam guiar os usuários desde a descoberta do sexo heterogamético até a identificação da região de determinação sexual (RDS).

9. A quebra cromossômica em neopoliploides de Arabidopsis thaliana ocorre preferencialmente em sítios frágeis candidatos, localizados juntamente com rearranjos genômicos ancestrais.
Srikant, T. e outros. bioRxiv · 1 publicação · 22 curtidas · 9 republicações em Bluesky

Poliploides recém-formados frequentemente sofrem extensa aneuploidia e rearranjos cromossômicos. Investigamos se esses rearranjos são previsíveis e conservados entre genótipos. Quantificamos a aneuploidia de cromossomos inteiros e segmentares em conjuntos de progênie de Arabidopsis thaliana neopoliploide de duas acessões (Col-0 e L er). 29% da progênie apresentou aneuploidias de cromossomos inteiros e/ou segmentares. Surpreendentemente, a aneuploidia segmentar surgiu exclusivamente da L er, preferencialmente por via materna, demonstrando que o genótipo e o sexo de origem são relevantes.

PlantEvolution 🌱🌾 @plantevolution.bsky.social · no Bluesky

Novo trabalho incrível de @thanvisrikant.bsky.social e @kbomblies.bsky.social: Cromossomos em neopoliploides de #Arabidopsis thaliana quebram preferencialmente em locais frágeis que correspondem a rearranjos genômicos ancestrais.
#ciênciadasplantas
www.biorxiv.org/content/10.6...

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10. A exposição da planta-mãe ao fogo aumenta a germinação da prole.
Gegunde, J., Castellanos, MC, Pausas, JG · Ecologia · 1 publicação · 19 curtidas · 7 republicações em Bluesky

Plantas que rebrotam após incêndios experimentam condições drasticamente alteradas em ambientes pós-incêndio. No entanto, os efeitos da exposição das plantas ao fogo sobre as características da prole permanecem pouco estudados. Muitas espécies que rebrotam são plantas herbáceas que florescem e frutificam rapidamente após o fogo (ou seja, floração estimulada pelo fogo), desenvolvendo suas sementes sob maior disponibilidade de recursos e interações bióticas modificadas, particularmente polinização intensificada. Nossa hipótese é que essas mudanças podem melhorar o desenvolvimento inicial da prole por meio do fornecimento materno de nutrientes e do aumento da qualidade da visitação floral e da deposição de pólen. Para testar essa hipótese, selecionamos três geófitas mediterrâneas (Asphodelus cerasifer, Drimia maritima, Narcissus assoanus) e comparamos a massa de sementes (3161 sementes) e a germinação total (2262 sementes) entre pares de plantas queimadas e não queimadas adjacentes durante a primeira estação de frutificação pós-incêndio, amostrando seis populações ao longo de 4 anos.

11. Desenvolvimento de uma ferramenta de marcação por proximidade baseada em TurboID para rastrear secretomas dinâmicos sob estresse salino. 💰
Lin, D. et al. · New Phytologist · 1 publicação · 19 curtidas · 7 republicações em Bluesky

As proteínas secretoras são essenciais para o desenvolvimento vegetal e a adaptação ambiental, contudo, a análise seletiva de cargas transportadas pela via convencional do retículo endoplasmático (RE)-Golgi permanece um desafio técnico, visto que os secretomas apoplásticos contêm proteínas provenientes de múltiplas vias de secreção. Desenvolvemos um método de marcação por proximidade TurboID ancorado ao RE para enriquecer seletivamente proteínas que entram na via secretora convencional em Arabidopsis thaliana.

12. Um atlas de sementes de Hypoxis do leste da América do Norte 💰
Zona, S. et al. · O Jornal da Sociedade Botânica de Torrey · 1 publicação · 27 curtidas · 4 republicações em Bluesky

A micromorfologia das sementes de seis espécies de Hipoxis (Hypoxidaceae) do leste da América do Norte (leste do Texas) foi estudada com microscopia eletrônica de varredura em baixo vácuo usando o detector de retroespalhamento. A forma das células do tegumento da semente e a configuração da cutícula mostraram-se características de uma espécie em particular.

13. Da pétala ao metal: O lento caminho para a automatização da rotulagem fenológica em larga escala de espécimes de herbário
Grady, EL e outros. Aplicações em Ciências Vegetais · 1 publicação · 19 curtidas · 6 republicações em Bluesky

Neste trabalho, apresentamos um pipeline de aprendizado de máquina que utiliza uma abordagem de modelagem de conjunto para detectar flores em espécimes de herbário e disponibilizar esses dados para a comunidade de pesquisa em fenologia. Após testarmos diversas estratégias para gerar dados de treinamento, descobrimos que anotações internas, com curadoria de especialistas, foram essenciais para produzir resultados confiáveis.

14. A abscisão de frutos imaturos é desencadeada por alterações hormonais na casca da semente do abacate.
Haberman, A. e outros. Revista de Botânica Experimental · 1 publicação · 7 curtidas · 7 republicações em Bluesky

Neste estudo, demonstramos que os frutículos destinados à abscisão sofrem parada de crescimento antes de encolherem e se desprenderem da árvore. Análises comparativas de RNA-seq indicaram que a parada de crescimento está associada a uma reprogramação do transcriptoma, iniciada inicialmente na casca da semente e posteriormente transmitida ao pericarpo e ao embrião. Resultados de expressão gênica e perfil hormonal indicaram que a parada de crescimento dos frutículos está associada a uma diminuição na atividade da auxina e a um aumento no ácido abscísico, no precursor do etileno, no ácido 1-aminociclopropano-1-carboxílico e no jasmonato bioativo jasmonoil-isoleucina na casca da semente.

15. A microscopia de alta resolução de células vegetais inteiras revela alterações induzidas por vírus na conectividade intercelular.
Reagan, Colúmbia Britânica e outros. bioRxiv · 1 publicação · 15 curtidas · 4 republicações em Bluesky

Os plasmodesmos (PD) fornecem aos vírus de plantas uma rota direta para a disseminação de célula para célula. A infecção viral aumenta o tráfego intercelular via PD, um processo denominado de controle de fluxo, mas o mecanismo envolvido permanece obscuro. Aqui, utilizando uma combinação de microscopia eletrônica de alta resolução e imagens de células vivas, demonstramos que diversos vírus aumentaram o número de PD em folhas infectadas.

16. Modificações diferenciais de ubiquitina nas subunidades VPS37-1 e VPS28-2 do complexo ESCRT-I regulam positivamente a imunidade vegetal.
Wang, C. e outros. New Phytologist · 2 publicações · 9 curtidas · 4 republicações em Bluesky

Neste estudo, demonstramos que XBAT35.2 interage in vivo com dois componentes-chave do complexo ESCRT-I, VPS37-1 e VPS28-2. XBAT35.2 ubiquitina VPS37-1 com cadeias de poliubiquitina ligadas a K48, levando à sua degradação proteassômica, e modifica VPS28-2 com cadeias ligadas a K63, reduzindo sua interação com FLS2.

17. Da era glacial aos dias atuais: Expansão clonal e variação genética no bosque de coníferas mais antigo do mundo. 💰
Marthick, JR e outros. American Journal of Botany · 1 publicação · 6 curtidas · 6 republicações em Bluesky

A clonalidade é comum entre as plantas, mas os processos que regem a diversidade genética nos clones mais antigos ainda são pouco estudados. Investigamos essa dinâmica usando um conjunto clonal de uma espécie arbórea de 10,500 anos, uma das mais longevas do mundo, a conífera paleoendêmica Lagarostrobos franklinii, no Monte Read, na Tasmânia Ocidental.

18. Compreensão e engenharia das interações receptor-ligante
Doblas, VG e outros · The Plant Journal · 1 publicação · 9 curtidas · 5 republicações em Bluesky

Nesta edição especial, uma série de revisões oportunas destaca temas novos e emergentes nas interações receptor-ligante, bem como uma nova compreensão das vias clássicas de receptores. Ao entender os mecanismos moleculares da função dos receptores, a engenharia de redes de reconhecimento e sinalização torna-se viável.

19. O sequenciamento de RNA de núcleo único revela a trajetória de desenvolvimento e as redes regulatórias transcricionais dos tricomas em
Artemisia annua
Lv, Z. e outros. Revista de Botânica Experimental · 1 publicação · 10 curtidas · 4 republicações em Bluesky

A artemísia-doce (Artemisia annua) produz e deposita artemisinina em seus tricomas glandulares, mas os mecanismos moleculares do desenvolvimento dos tricomas ainda são pouco compreendidos. Neste estudo, realizamos o sequenciamento de RNA de núcleo único em plântulas de A. annua com 10 dias de idade, revelando a expressão específica de RNA nas células dos tricomas foliares.

20. O nitrato altera transitoriamente a transcrição no xilema em desenvolvimento de Populus madeira para promover a expansão celular via CRF4
Choudhary, S. e outros. A célula vegetal · 2 publicações · 5 curtidas · 4 republicações em Bluesky

O nitrato funciona tanto como nutriente quanto como molécula sinalizadora, mas ainda não se sabe como ele é percebido e traduzido em respostas de desenvolvimento nos tecidos lenhosos. Neste estudo, demonstramos que o xilema em desenvolvimento do álamo híbrido (Populus tremula × P. tremuloides) apresenta uma resposta transcricional rápida e específica para cada tipo celular ao nitrato, que promove a expansão das células do xilema.

Imagem da capa: Clipart.