Aqui está um resumo dos 20 artigos mais populares que vocês compartilharam esta semana no Bluesky. Os artigos pagos estão marcados com um 💰; caso contrário, o acesso é gratuito no momento da verificação.
O formato está um pouco diferente esta semana. Estou tentando desenvolver um programa que ajude os editores a formatar o artigo para e-mail e web, para que outra pessoa possa fazer isso no futuro. O processo ainda não está totalmente concluído.
Como isso funciona
Analisamos as postagens de pessoas no Botânica Auto Liste e selecione as entradas com links para os artigos. Cada vez que um artigo for mencionado em uma postagem, ele ganha 4 pontos. Um compartilhamento gera 3 pontos e uma curtida, 1 ponto.
Tentamos adicionar pessoas à lista de discussão automática de Botânica se elas publicarem sobre Botânica (não precisam ser links para artigos) em cerca de 20% ou mais das suas postagens. Acreditamos que, como a lista como um todo compartilha o interesse por plantas, esse tipo de conteúdo tende a se destacar.
Se você acha que deveria estar na lista da Botany Auto, mas não está, envie uma mensagem para @botany.one no Céu Azul.
Uma receita para um bom π. Como estimar corretamente as estatísticas sumárias da genética de populações e por que devemos relatá-las sistematicamente.
Brault, M. e outros. Biologia e Evolução do Genoma
No contexto do questionamento da utilidade de produzir uma quantidade tão grande de dados genômicos, seja por razões ecológicas ou econômicas, argumentamos que a publicação de dados deve ser padronizada para garantir a reutilização a longo prazo. Com base em uma revisão da literatura e exemplos relevantes, enfatizamos que, apesar do crescente volume de dados disponíveis, a falta de documentação metodológica e a ausência de metadados tornam a maioria dos conjuntos de dados de polimorfismo publicados incomparáveis, impedindo o cálculo de estatísticas significativas e a aplicação dos princípios FAIR (Localizável, Acessível, Interoperável e Reutilizável).
Jeffrey Ross-Ibarra @jrossibarra.bsky.social · no Bluesky
Pessoal. @ksamuk.bsky.social e outros já apresentaram esse argumento antes. Existem bons softwares para fazer isso corretamente. Aqui está o argumento novamente:
Os sítios invariantes são importantes! Eles não estão presentes no seu arquivo VCF padrão, e muitos programas fingem que estão.
academic.oup.com/gbe/article/...
Antagonistas extracelulares: ataque e contra-defesa no apoplasto 💰
Armer, VJ, van der Hoorn, RAL · Revisão Anual de Fitopatologia
As interações extracelulares são cruciais na corrida armamentista entre plantas e patógenos. Patógenos fúngicos, bacterianos e oomicetos manipulam o apoplasto para controlar o pH, a absorção de água, os níveis de açúcar e a disponibilidade de nutrientes. As plantas respondem à infecção com uma explosão oxidativa e secretam metabólitos tóxicos e hidrolases prejudiciais, mas os patógenos adaptados desenvolveram maneiras complexas de neutralizar os metabólitos reativos e tóxicos das plantas e de inibir ou degradar as hidrolases. Os patógenos também evitam seu reconhecimento ocultando, degradando ou modificando seus elicitores e desativando receptores da superfície celular de diversas maneiras. Nesta revisão, resumimos nosso conhecimento atual sobre os fascinantes mecanismos de ataque e contra-defesa nas interações extracelulares entre plantas e patógenos.
Destaque Global em Ciências Vegetais @plant-sci.bsky.social · no Bluesky
🌱🧬Os patógenos manipulam o apoplasto controlando o pH, a água e os nutrientes. As plantas reagem com explosões oxidativas, toxinas e hidrolases. Patógenos adaptados desarmam essas defesas e se escondem da detecção.
Corrida armamentista molecular fora da célula @annualreviews.bsky.social www.annualreviews.org/content/jour...
Reduzir a variabilidade nas avaliações das condições do habitat é fundamental para que as métricas do mercado da natureza representem mudanças reais na biodiversidade.
Salamanca Leão, I. e outros. Ciência e Prática da Conservação
A necessidade de métricas padronizadas para medir perdas e ganhos de biodiversidade levou muitos países e iniciativas do setor privado a buscarem adaptar a Métrica Estatutária de Biodiversidade da Inglaterra para o Ganho Líquido de Biodiversidade (GLB) obrigatório. O GLB exige um aumento mínimo de 10% nas unidades de biodiversidade provenientes do desenvolvimento de infraestrutura, e o número de unidades de biodiversidade depende, em parte, de avaliações de campo das condições do habitat. Realizamos simulações para explorar a influência da incerteza nas avaliações de condição e descobrimos que existe uma variabilidade inerente que introduz viés, mesmo quando a condição real de um habitat permanece inalterada.
Julia PG Jones @juliajones.bsky.social · no Bluesky
Você tem interesse em Ganho Líquido de Biodiversidade, créditos de biodiversidade ou métricas de biodiversidade em geral?
Se for esse o caso, então este tópico (nosso novo artigo) é para você!
Analisamos a eficácia da métrica oficial de biodiversidade da Inglaterra para medir mudanças. #BNG
conbio.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/...
Biogeografia das interações bióticas: uma estrutura para compreender como as interações entre espécies moldam os padrões de biodiversidade em diferentes escalas.
Galiana, N.Araújo, MB · PLOS Biology
A integração entre biogeografia e ecologia tem sido historicamente limitada devido à falta de dados sobre interações bióticas em grandes escalas espaciais. O surgimento de novos métodos e dados de alta qualidade sobre redes ecológicas em escalas biogeográficas está abrindo caminho para uma integração mais profunda entre biogeografia e ecologia. Este ensaio examina essa integração por meio de três áreas de pesquisa interconectadas: os efeitos das interações bióticas na distribuição de espécies; a influência de gradientes ambientais nas interações bióticas; e os efeitos das interações bióticas no meio ambiente. Os avanços recentes e os principais desafios são discutidos, e sugestões são apresentadas sobre como aprimorar a compreensão dos padrões e processos da biodiversidade em diferentes escalas.
Discutido no Bluesky por @bjenquist.bsky.social.
Os campos de cultivo complementam a biodiversidade em pastagens permanentes nas paisagens europeias.
Boetzl, FA e outros. Natureza das Comunicações
Utilizando 86 pares de pastagens permanentes e campos de colza em cinco países europeus, avaliamos como o tipo de habitat molda as comunidades de plantas, borboletas, abelhas selvagens e carabídeos, e se o aumento da área de pastagens nas paisagens circundantes promove a transferência da biodiversidade associada às pastagens para os campos de colza. Constatamos que o tipo de habitat, e não a quantidade de pastagens em nível de paisagem, determina a diversidade e molda as comunidades de espécies: plantas e borboletas são mais diversas em pastagens, enquanto abelhas selvagens e carabídeos são igualmente ou mais diversos em campos de colza.
Fabian A. Boetzl @fboetzl.bsky.social · no Bluesky
Acabou de sair do forno! 📄Descobrimos que os campos agrícolas e os pastos seminaturais sustentam uma #biodiversidade complementar em toda a #Europa. Os habitats seminaturais por si só são insuficientes para garantir a biodiversidade das terras agrícolas - a gestão dos campos agrícolas de forma favorável à biodiversidade é essencial. www.nature.com/articles/s41...
Ver no Bluesky →Melhorar a gestão de detritos naturais nas praias para a conservação da biodiversidade. 💰
Gómez-Serrano, M. Á. · Tendências em ecologia e evolução
Os detritos naturais depositados pelo mar são essenciais para o funcionamento do ecossistema praiano. Com o aumento da procura turística no litoral, os valores estéticos tornam-se mais importantes e a limpeza indiscriminada de detritos alastra-se das praias urbanas para as praias naturais. É necessária uma mudança na gestão dos detritos nas praias para garantir que os detritos orgânicos desempenhem o seu papel onde foram depositados pelo mar.
Miguel A Gómez Serrano @gomezserrano-ma.bsky.social · no Bluesky
Os restos marinhos são essenciais para a conservação das aves que criam nas praias: www.cell.com/trends/ecolo...
Os pollos de Chorlitejo patinegro se escondem neles toda vez que se trata de um perigo, o que inclui passageiros e banhistas. Manter os restos no seu local é vida para eles
Ver no Bluesky →A análise integrada de fósseis e estimativas de tempo de divergência molecular aponta para uma origem das angiospermas no final do Jurássico.
Wu, R. et al. · plantas Natureza
As escalas de tempo moleculares baseiam-se na calibração da evolução molecular ao tempo geológico usando restrições fósseis, mas as estratégias de calibração convencionais utilizam dados fósseis limitados e frequentemente interpretados subjetivamente. Aqui, utilizamos o modelo Bayesiano de Ponte Browniana para derivar densidades de calibração orientadas por dados, com base em extensos dados de ocorrência de fósseis. Essa abordagem integra a incerteza sobre a diversidade atual e histórica para estimar a idade dos clados.
plantas Natureza @natplants.nature.com · em Bluesky
Novo artigo de acesso aberto: "Análise integrada de fósseis e estimativas de tempo de divergência molecular apontam para uma origem das angiospermas no Jurássico Superior" rdcu.be/foNXh
... sugerem uma origem das plantas com flores no Jurássico Superior, indicando uma história inicial enigmática das angiospermas.
Ver no Bluesky →A qualidade da paisagem influencia as respostas ecológicas à perda e fragmentação do habitat.
Fletcher Jr, RJ e outros · Ecologia e Evolução da Natureza
Estudos sugerem que a qualidade das terras que circundam os fragmentos de habitat pode modificar os efeitos da perda e fragmentação de habitat sobre as espécies e influenciar as previsões de biodiversidade em diferentes regiões. Como as matrizes da paisagem tendem a ser complexas e variam com as mudanças no habitat, isolar esses efeitos é um desafio. Aqui, desvendamos os efeitos da perda de habitat, da fragmentação e da qualidade da paisagem circundante em um experimento manipulativo de grande escala em um sistema planta-herbívoro.
Roberto Fletcher @fletcherecology.bsky.social · no Bluesky
Acabei de lançar – estou animada para compartilhar:
As áreas circundantes aos habitats remanescentes têm efeitos desproporcionais para as espécies – tão grandes ou maiores do que a perda e fragmentação do habitat.
Foi um enorme esforço experimental isolar a atribuição para a ecologia da paisagem e a conservação.
@camzoology.bsky.social @brunalab.bsky.social
A análise do perfil de atividade policromática distingue as cisteína proteases e suas isoformas em plantas.
Zhen, K. et al.b · bioRxiv
A análise de perfil baseada em atividade com sondas fluorescentes é uma ferramenta poderosa para a caracterização funcional de classes inteiras de enzimas em proteomas brutos. Neste estudo, descobrimos que coquetéis de sondas compostos pelo grupo funcional E-64, contendo diferentes fluoróforos ligados por pequenos espaçadores, distinguem a marcação de proteases de cisteína do tipo papaína e suas isoformas devido à sua afinidade diferencial por essas sondas. Isso resulta em uma marcação policromática com cores aparentes específicas para diferentes famílias e isoformas de proteases.
Mariana Schuster @marischuster.bsky.social · no Bluesky
Estou muito feliz em compartilhar esta história sobre como os coquetéis podem ajudar na sua pesquisa sobre proteínas 🍸.
www.biorxiv.org/content/10.6...
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Antecipe, aclimate-se, recupere-se e lembre-se: como a integração de sinais espaço-temporais controla a resiliência ao estresse hídrico em plantas. 💰
Rodriguez-Cisneros, C. e outros. Revista de Botânica Experimental
Inundações são um importante estresse abiótico que restringe o crescimento e a sobrevivência de plantas terrestres. A capacidade de um tecido vegetal evitar ou suportar a privação crítica de oxigênio (hipóxia) e os subsequentes danos causados pela reoxigenação é vital para sua sobrevivência. A submersão desencadeia uma rápida sinalização de etileno e hipóxia que, por sua vez, controla as respostas de aclimatação, promovendo a resiliência da planta. Curiosamente, uma ampla gama de fatores ambientais e internos adicionais demonstrou influenciar essas vias de sinalização canônicas associadas à aclimatação e tolerância a inundações. Aqui, discutimos como essa sinalização integrativa dependente de etileno e hipóxia permite que as plantas antecipem e se preparem para o potencial estresse hipóxico induzido por inundações, ajustem a aclimatação de acordo com o contexto metabólico ambiental e interno e orquestrem efetivamente as respostas de reoxigenação.
Destaque Global em Ciências Vegetais @plant-sci.bsky.social · no Bluesky
🌿💧 Inundações desencadeiam a produção de etileno e a sinalização da hipóxia. As plantas antecipam, aclimatam-se, recuperam-se e memorizam. Essa memória do estresse auxilia na sobrevivência contra futuras inundações.
Sinalização integrativa para resiliência. #ciênciadasplantas
@jxbotany.bsky.social @hartman-plantlab.com academic.oup.com/jxb/avançar-...
O receptor imune vegetal LORE liga-se a ligantes agonistas e antagonistas de ácidos graxos 3-hidroxi por meio de um laço dinâmico em seu domínio de lectina do tipo G.
Shu, LJ e outros. bioRxiv
Lin Jie Shu @linjieshu.bsky.social · no Bluesky
A primeira estrutura de ligação a ácidos graxos em um “domínio de lectina do tipo G” entre os PRRs de plantas foi verificada!
Um novo artigo da série LORE foi publicado pelo laboratório Ranf na TUM, na Alemanha, pela Universidade de Friburgo, na Suíça, e por @antonelladipizio.bsky.social na TUM: doi.org/10.64898/202...
Aqui estão alguns destaques interessantes:
Desvendando a proteólise vegetal: sensores fluorescentes geneticamente codificados como ferramentas para o perfilamento da atividade de proteases. 💰
Fernández-Fernández, Á. D. e outros. A célula vegetal
Biologia de Sistemas Vegetais @psb-vib.bsky.social · no Bluesky
ARTIGO de @vanbreusegemlab.bsky.social e @moritznowack.bsky.social em @theplantcell.bsky.social
academic.oup.com/plcell/advan...
A modelagem genômica da ligação de fatores de transcrição em plantas identifica variantes regulatórias associadas a características fenotípicas.
Peleke, FF e outros. · Natureza das Comunicações
Leibniz IPK @leibnizipk.bsky.social · no Bluesky
Uma equipe liderada por @leibnizipk.bsky.social e @fz-juelich.de desenvolveu um modelo de IA que prevê onde proteínas reguladoras se ligam ao DNA das plantas para ativar e desativar genes. O estudo foi publicado na revista "Nature Communications".
➡️Papel: tinyurl.com/mryxendn
➡️RP: tinyurl.com/37kpbpzh
Ver no Bluesky →Visualização da dupla fertilização no milho
Calhau, AR, Widiez, T. · bioRxiv
Thomas Widiez @thomaswidiez.bsky.social · no Bluesky
Temos o prazer de compartilhar nosso protocolo para imageamento da dupla fertilização em milho! 🌽🔬
📖 www.biorxiv.org/content/10.6...
Esperamos que este recurso seja útil para pesquisadores que estudam a reprodução de plantas, a fertilização e o desenvolvimento inicial das sementes.
Ver no Bluesky →A análise integrativa da fotossíntese CAM revela seu impacto no metabolismo primário em Iúca
Wickell, D. e outros. Revista de Botânica Experimental
Carolina Heyduk @kheyduk.bsky.social · no Bluesky
Artigo de laboratório explorando a ômica integrada em espécies de Yucca C3 e CAM intimamente relacionadas. Atraí o @wickellomics.bsky.social para o laboratório com este conjunto de dados como "uma oportunidade fácil", mas não foi nada fácil, rs. Agradeço ao David e a todos os coautores por tornarem isso possível! doi.org/10.1093/jxb/... 1/2
Ver no Bluesky →Indução de haploides in planta em milho e tomate através da interrupção do gene KOKOPELLI
Jacquier, NM e outros. bioRxiv
Thomas Widiez @thomaswidiez.bsky.social · no Bluesky
A semana de pré-prints 😅!.. Segundo manuscrito agora no BioRxiv
▶️ A edição genômica de KOKOPELLI confere capacidade de indução haploide não em apenas um, mas em
Duas culturas: 🌽 milho e 🍅 tomate
📖 doi.org/10.64898/202...
Um enorme agradecimento a todos os envolvidos e aos nossos colaboradores: @nathaliegonzalez.bsky.social, @inrae-bfp.bsky.social
Ver no Bluesky →O estresse térmico induz a formação de gametas masculinos não reduzidos ao direcionar a tradução nos meiócitos de Arabidopsis. 💰
Schindfessel, C. e outros. A célula vegetal
A célula vegetal @theplantcell.bsky.social · no Bluesky
O estresse térmico induz a formação de gametas masculinos não reduzidos, visando a tradução em meiócitos de Arabidopsis (Cédric Schindfessel, Albert Cairo, Pavlína Mikulková, Chunlian Jin, Laura Lamelas, Philip A Wigge, Karel Říha, Danny Geelen) doi.org/10.1093/plce... #CiênciasVegetais @aspbofficial
Ver no Bluesky →Plastoglóbulos compartimentalizam a assimilação de nitrogênio no milho - Nature
Chen, D. et al. · Natureza
Ben Field 🌿 @benfield1.bsky.social · no Bluesky
Plastoglóbulos cloroplásticos compartimentalizam a assimilação de nitrogênio no milho #ciênciadasplantas www.nature.com/articles/s41...
Ver no Bluesky →Digitalização de acervos para desbloquear todo o potencial da palinologia: um estudo de caso com o acervo de palinologia do Smithsonian.
Jaramillo, C. e outros. PLANTAS, PESSOAS, PLANETA
Plantas, pessoas, planeta @plantspeopleplanet.bsky.social · no Bluesky
Digitalizando coleções para desbloquear todo o potencial da #palinologia: um estudo de caso com a coleção de palinologia do Smithsonian.
Artigo sobre Métodos e Técnicas de Carlos Jaramillo, et al.
nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/...
#ÚltimaEdição #CiênciaDasVegetais
Ver no Bluesky →Quando a morfologia permanece estática: evolução floral restrita em um gênero de leguminosas megadiverso
Maianne, M. e outros. Annals of Botany
Annals of Botany @annbot.bsky.social · no Bluesky
🎉 Boas notícias! O artigo "Quando a morfologia permanece estática: evolução floral restrita em um gênero de leguminosas megadiverso" em @annbot.bsky.social, de M. Maianne @mimomaianne.bsky.social, está agora #gratuito por 2 semanas 🧵1/10
👉 doi.org/rbsb
@souzayagob.bsky.social
@fmachado.bsky.social
@aquitemcaqui.bsky.social
Ver no Bluesky →Imagem da capa: Driftwood por @abigalejachyms-team / Canva
