Ciência Compartilhada: 29º de agosto

Aqui está o resumo desta semana. Encontrar uma imagem que combine com os artigos pode ser difícil às vezes. Por exemplo, eu queria pesquisar por imagens de pradarias, mas muitas fotos de pradarias focam no predador escondido na grama. No entanto, uma busca por Andropogon Esta foto mostra uma silhueta criada por uma aurora boreal. Como de costume, os artigos pagos estão marcados com um 💰; caso contrário, o acesso é gratuito no momento da verificação.

1. A destruição das pastagens causa alterações nas características das plantas que persistem durante a recuperação. 💰
Nerlekar, AN e outros. Proceedings, da Academia Nacional de Ciências · 2 publicações · 53 curtidas · 27 republicações em Bluesky

Sintetizamos dados de características de 742 espécies de plantas provenientes de 24 estudos em seis continentes para compreender como as espécies vegetais indicativas de pastagens primárias e secundárias se comparam em suas características. Em comparação com as pastagens primárias, as plantas indicativas de pastagens secundárias eram mais altas e apresentavam folhas com maior teor de nitrogênio, maior área foliar específica e menor teor de matéria seca.

2. A sinalização TOR-NOT4 acopla a tradução ao controle de qualidade cotraducional em plantas.
Schwarze, MA e outros. Natureza das Comunicações · 1 publicação · 42 curtidas · 21 republicações em Bluesky

A síntese proteica deve ser rigorosamente coordenada com o controle de qualidade para prevenir o estresse proteotóxico, contudo, os mecanismos subjacentes à vigilância cotraducional em plantas, e como estes se alinham com a produção proteica, ainda são pouco compreendidos. Aqui, identificamos três ligases de ubiquitina E3 do tipo NOT4 em Arabidopsis thaliana como reguladoras do controle de qualidade proteica cotraducional e revelamos uma ligação funcional entre a sinalização de NOT4 e TOR (TARGET OF RAPAMYCIN) que coordena a capacidade de controle de qualidade com a produção proteica.

3. Plantas herbáceas em ecossistemas florestais: cem questões fundamentais e aplicadas
Radhamoni, HVN e outros. Jornal de Ciências da Vegetação · 1 publicação · 22 curtidas · 13 republicações em Bluesky

Compreendendo essa lacuna de conhecimento e reconhecendo a importância crucial de expandir e otimizar o escopo da pesquisa sobre ervas florestais, propusemo-nos a identificar 100 questões fundamentais e aplicadas relacionadas à ecologia desse distinto grupo de plantas. Inicialmente, realizamos uma pesquisa amplamente divulgada online para a comunidade ecológica, que gerou um total de 130 perguntas. Em seguida, promovemos um workshop de três dias com pesquisadores de ervas convidados, especialistas em diversos ecossistemas florestais, durante o qual as perguntas foram refinadas por meio de múltiplas rodadas de discussão, revisão e reformulação.

Martin Dovciak🌳🌱🌻 @dovciak-lab.bsky.social · no Bluesky

🌿 Novo artigo! O estrato herbáceo das florestas pode representar até 80% da diversidade vegetal, mas ainda é pouco estudado.

Fico feliz por ter contribuído para esta colaboração liderada por Yale, que identificou 100 questões para o avanço da ecologia do estrato herbáceo florestal.

O que perdemos?

🔗 onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10....

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4. Previsão da complexidade de organismos vegetais com base na anotação de fatores de transcrição: uma abordagem de IA
Varshney, D. e outros. bioRxiv · 1 publicação · 16 curtidas · 11 republicações em Bluesky

A forma como a complexidade morfológica evolui ainda é um enigma. Embora haja evidências em algas e plantas, bem como em animais, de que a diversificação do repertório de fatores de transcrição (FT) seja a causa da evolução da complexidade dos organismos, existem muitos exemplos de linhagens que seguem seu próprio caminho de evolução da complexidade, por exemplo, pela expansão de famílias específicas... Aqui, expandimos um conjunto de dados previamente disponível sobre o número de tipos celulares de 12 para 82 proteomas e introduzimos um esquema de plano corporal de quatro classes.

5. Mais rápido, maior, mais severo: a propagação extrema de incêndios florestais prepara o terreno para mudanças nos ecossistemas florestais no oeste e na região boreal da América do Norte.
Cooperativa, JD e outros. Os avanços da ciência · 1 publicação · 25 curtidas · 7 republicações em Bluesky

Um número relativamente pequeno de incêndios florestais de rápida propagação queima áreas desproporcionalmente grandes. Mas, além da área queimada, os incêndios rápidos produzem resultados ecológicos distintos após o fogo? Aqui, medimos as taxas diárias de crescimento linear do fogo e avaliamos as relações entre a propagação do fogo, a severidade da queimada e as métricas de resiliência da paisagem após o fogo, a partir de 3499 incêndios ocorridos entre 2012 e 2023 em florestas dominadas por coníferas no Canadá e no oeste dos EUA.

Discutido no Bluesky por @grumpyunclesean.bsky.social.

6. ORF2 do vírus X da botrite suprime o silenciamento de RNA de maneira dependente do gatilho e está associado à alteração da expressão de genes do tipo Dicer em Botrytis cinerea
Lalany, F. e outros. bioRxiv · 1 publicação · 15 curtidas · 9 republicações em Bluesky

A interferência de RNA (RNAi) é um mecanismo central de defesa antiviral em fungos, contudo, relativamente poucos supressores micovirais do silenciamento de RNA (VSRs) foram caracterizados funcionalmente, particularmente em hospedeiros fitopatogênicos. O vírus X de Botrytis (BVX), um vírus de RNA de fita positiva da família Alphaflexiviridae, infecta Botrytis cinerea e codifica cinco quadros de leitura abertos (ORFs) previstos, a maioria dos quais com funções desconhecidas. Neste estudo, investigamos a atividade supressora do silenciamento de RNA dos ORFs 2 a 5 do BVX utilizando ensaios complementares baseados em GFP em Nicotiana benthamiana e examinamos o principal candidato no hospedeiro fúngico B. cinerea.

7. Palette — um sistema para visualizar os níveis de expressão de genes-alvo em orquídeas. 💰
Yang, Z. e outros. Fisiologia vegetal · 1 publicação · 15 curtidas · 9 republicações em Bluesky

Ao misturar dois tipos de pigmentos vegetais, como um artista que combina cores em uma paleta para criar novas cores de flores usando múltiplos métodos de transformação genética, esta pesquisa fornece um sistema visível para rastrear a expressão gênica em orquídeas.

8. Impacto do nitrogênio em fungos ectomicorrízicos: da troca de recursos ao ciclo do carbono florestal
Cox, F. · Revista de Botânica Experimental · 1 publicação · 11 curtidas · 8 republicações em Bluesky

Sabe-se que o nitrogênio inorgânico (N) influencia a composição e o funcionamento das comunidades de fungos ectomicorrízicos (ECM). Pesquisas consistentemente destacam características fúngicas relacionadas ao uso de carbono (C) como determinantes-chave da sensibilidade dos fungos a níveis elevados de N inorgânico, com fungos ECM mais exigentes em C apresentando declínio ao longo de gradientes de N inorgânico. Esse declínio é frequentemente atribuído à redução da alocação de C das árvores hospedeiras para seus simbiontes fúngicos, porém os mecanismos precisos subjacentes a essa redução permanecem obscuros, apesar dos significativos esforços de pesquisa. Aqui, são examinados os avanços recentes nessa área, destacando o papel das necessidades nutricionais dos fungos e da dinâmica fonte-dreno na regulação do fluxo de C para os fungos ECM.

Revista de Botânica Experimental @jxbotany.bsky.social · no Bluesky

🌲 OPINIÃO DE ESPECIALISTA 🌲

Uma discussão sobre os avanços recentes em como a troca de recursos entre plantas e ectomicorrizas pode impulsionar as respostas das comunidades de fungos ectomicorrízicos à disponibilidade de nitrogênio, juntamente com os efeitos no ciclo do carbono florestal - Filipa Cox

🔗 doi.org/10.1093/jxb/...
#CiênciaDasVegetais 🧪

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9. Endossimbiontes bacterianos aumentam a virulência fúngica ao interromper o rizobioma supressor de doenças. 💰
Zhou, X. <em>et al.</em> · Hospedeiro celular e micróbio · 1 publicação · 13 curtidas · 7 republicações em Bluesky

Os mecanismos pelos quais endossimbiontes bacterianos (bactérias que vivem dentro de células fúngicas) aumentam a aptidão e a virulência de patógenos fúngicos ainda são pouco compreendidos. Neste estudo, relatamos que o patógeno causador da murcha de Fusarium em tomateiros... Fusarium oxysporum f. sp. licopersici (FOL) anfitriões Achromobacter endossimbiontes spp. que aumentam a virulência fúngica.

10. Imunidade atípica induzida por água extracelular em plantas
Gaudreault-Lafleur, F. et al. · bioRxiv · 2 publicações · 14 curtidas · 5 republicações em Bluesky

Um mecanismo de virulência fundamental e observável, empregado por um grande número de patógenos microbianos para causar doenças, é a indução de um nicho rico em água no espaço extracelular (isto é, o apoplasto) de seu hospedeiro, conhecido como lesões encharcadas. Dada a ubiquidade desse mecanismo de virulência, questionamos se as plantas respondem à água extracelular induzida por patógenos ativando programas imunológicos.

11. Mecanismos de tolerância à dessecação na linhagem verde e além
Schuster, J., VanBuren, R. · New Phytologist · 1 publicação · 15 curtidas · 6 republicações em Bluesky

Neste trabalho, sintetizamos nossa compreensão atual das origens evolutivas e dos mecanismos centrais que sustentam a tolerância à dessecação em plantas, e os inserimos em um contexto comparativo mais amplo entre os reinos.

12. Vidas em um grama de solo: conectando a biologia do ciclo de vida à ecologia do solo.
van Gestel, J. · O Jornal ISME · 1 publicação · 14 curtidas · 6 republicações em Bluesky

Neste ensaio, reflito sobre os ciclos de vida microbianos encontrados no solo. Partindo de um único grama de solo coletado em nosso campus, exploro os elementos conceituais fundamentais da biologia dos ciclos de vida, como esses ciclos emergem em seu ambiente e como se interconectam entre as espécies.

13. Panorama do transcriptoma de um patógeno bacteriano sob imunidade vegetal 💰
Nobori, T. et al. · Proceedings, da Academia Nacional de Ciências · 1 publicação · 20 curtidas · 4 republicações em Bluesky

Neste estudo, estabelecemos dois métodos para análise do transcriptoma bacteriano in planta utilizando sequenciamento de RNA. Ao analisar 27 combinações de mutantes de imunidade vegetal e cepas de Pseudomonas syringae, conseguimos identificar assinaturas transcriptômicas bacterianas específicas influenciadas pela ativação do sistema imunológico da planta.

14. A modelagem metabólica facilita o projeto de comunidades sintéticas ao simplificar as comunidades microbianas naturais. 💰
Lin, X. e outros. Microbiologia Ambiental · 1 publicação · 13 curtidas · 6 republicações em Bluesky

As comunidades microbianas naturais geralmente apresentam composições complexas e interações metabólicas pouco claras, o que limita suas aplicações. Esclarecer essas interações intrincadas dentro das comunidades microbianas é um desafio para os métodos tradicionais baseados em experimentos. Neste trabalho, desenvolvemos uma abordagem baseada em simulação para projetar comunidades sintéticas (SynComs), simplificando comunidades microbianas complexas por meio de modelagem metabólica.

15. Da água para a terra: evolução dos repertórios de genes de tRNA em organismos fotossintéticos
Hummel, G. e outros. A Revista EMBO · 1 publicação · 9 curtidas · 7 republicações em Bluesky

Os eucariotos fotossintéticos passaram por mudanças evolutivas de habitats aquáticos para terrestres, acompanhadas por alterações na organização do genoma e na regulação gênica. No entanto, a evolução dos repertórios de genes de RNA de transferência (tRNA) recebeu pouca atenção, apesar de seu papel central na tradução. Aqui, revisamos como o conteúdo, a estrutura e a organização genômica dos genes de tRNA se diversificaram ao longo das linhagens fotossintéticas, principalmente Archaeplastida, e como essas mudanças se relacionam com as transições evolutivas.

16. Repensando proteínas relacionadas à patogênese: de impulsionadoras da imunidade vegetal a nós de integração da resiliência ao estresse
Mudher Abu-Altemen, W., Castroverde, CDM · Revista de Botânica Experimental · 1 publicação · 11 curtidas · 6 republicações em Bluesky

Tradicionalmente vistas como proteínas de defesa contra infecções por patógenos, as proteínas relacionadas à patogênese (PR, do inglês Pathogenesis-related proteins) compreendem 19 famílias diversas, incluindo enzimas de defesa (glucanases, quitinases, nucleases, proteases), peptídeos antimicrobianos, inibidores enzimáticos e proteínas geradoras de espécies reativas de oxigênio (ROS). Embora sua importância durante estresses bióticos esteja bem documentada, pesquisas recentes têm se concentrado em sua regulação dinâmica e funções em estresses abióticos, como salinidade, seca, exposição a metais pesados, temperatura e alagamentos. Sintetizando descobertas recentes e lacunas críticas no conhecimento, propomos que as proteínas PR atuam como nós globais de integração do estresse em plantas, conectando respostas a estresses abióticos e bióticos.

17. A reprogramação dependente de ferro da sinalização do receptor de peptídeos associados a danos coordena a imunidade e a adaptação ao estresse por fosfato.
Tsuchida, N. et al. · bioRxiv · 1 publicação · 11 curtidas · 6 republicações em Bluesky

A adaptação das plantas à limitação de fosfato inorgânico (Pi) envolve uma extensa reprogramação metabólica e de desenvolvimento, denominada coletivamente de resposta à privação de fosfato (RPF). Como as plantas equilibram a aquisição de nutrientes com a competência imunológica permanece um mistério. Aqui, mostramos que a RPF remodela seletivamente a sinalização do receptor de reconhecimento de padrões (PRR) em Arabidopsis thaliana.

18. Técnicas e desafios no estudo da diversidade fotossintética em plantas vasculares submersas de água doce.
Loew-Mendelson, E. et al. · Aplicações em Ciências Vegetais · 2 publicações · 8 curtidas · 5 republicações em Bluesky

Embora a diversidade fotossintética das plantas aquáticas rivalize com a das espécies terrestres, as condições ambientais que sustentam essa diversidade diferem fundamentalmente. Apesar dessas diferenças ambientais, plantas aquáticas e terrestres desenvolveram mecanismos de concentração de carbono (MCCs) convergentes. No entanto, a caracterização dessas vias em plantas submersas está atrasada em relação aos sistemas terrestres devido às limitações metodológicas do ambiente aquático. Aqui, revisamos e avaliamos métodos contemporâneos para a detecção de MCCs em plantas aquáticas.

19. Um protocolo simples de transformação por perfuração de sementes para painço e painço-dedo.
Moin, M., Tyagi, W., Sreevarshitha, G. · AoB PLANTS · 1 publicação · 11 curtidas · 5 republicações em Bluesky

O painço-pérola e o painço-dedo enfrentam desafios na adoção de abordagens transgênicas ou de edição genética devido à sua resistência inerente aos protocolos de transformação genética. Para superar essas limitações, o presente estudo visa otimizar o protocolo de transformação genética para o painço-pérola e o painço-dedo.

20. Um complexo receptor de superfície celular STRUBBELIG–NHL3 medeia a resposta à deficiência de celulose em Arabidopsis.
Boikine, R. e outros. plantas Natureza · 1 publicação · 8 curtidas · 6 republicações em Bluesky

A remodelação da parede celular após a ruptura da integridade da parede celular por meio da inibição da biossíntese de celulose depende da quinase receptora STRUBBELIG (SUB) e de sua proteína de ligação QUIRKY (QKY). Neste estudo, identificamos a proteína 3 semelhante à NON-RACE SPECIFIC DISEASE RESISTANCE/HIN1 HAIRPIN-INDUCED (NHL3) como um fator adicional envolvido na resposta de inibição da biossíntese de celulose dependente de SUB.

Imagem de capa: Andropogon gerardi by -Rorey- / iNaturalista CC BY