Fungos micorrízicos são necessários para a germinação e estabelecimento de mudas em orquídeas, portanto associações podem estar envolvidas na determinação da hibridação entre as espécies. jacquemyn <em>et al.</em> mostram que em três espécies do gênero Orquídea (O. antropofora, O. militaris e O. purpurea) sementes originárias de cruzamentos híbridos germinam prontamente no campo, e os protocormos apresentam sobreposição em associações micorrízicas com seus respectivos pais. Assim, as associações parecem contribuir pouco para o isolamento reprodutivo nessas espécies.