O gênero Allium L., um dos maiores gêneros monocotiledôneas e que inclui muitas culturas economicamente importantes com valor nutricional e medicinal, tem sido o foco de estudos de classificação ou filogenia por séculos. Estudos recentes sugeriram que o gênero pode ser dividido em 15 subgêneros e 72 seções, que foram posteriormente classificadas em três linhagens evolutivas. No entanto, as relações filogenéticas reconstruídas por um ou dois loci mostraram suporte mais fraco, especialmente para a terceira linhagem evolutiva, o que pode não mostrar as relações entre as espécies com muita clareza e pode dificultar um estudo adaptativo e evolutivo mais aprofundado.

Deng-Feng Xie e colegas coletou um total de 39 genomas completos de cloroplastos de Allium (cobrindo 12 Allium subgêneros), e combinando-os com 125 espécies de plastomas de 19 outras famílias de monocotiledôneas, reconstruímos a filogenia do gênero Allium, estimou a origem e o tempo de divergência das três linhagens evolutivas e investigou a evolução adaptativa neste gênero e famílias relacionadas.

Seus resultados detectaram uma relação filogenética bem suportada de Allium. Os PSGs e PSGs com altos valores de Ka/Ks, bem como morfologias diversificadas, características cromossômicas complicadas e modos reprodutivos únicos podem desempenhar papéis importantes na adaptação e evolução de Allium espécies. Este é o primeiro estudo que realizou análises filogenéticas e evolutivas do gênero Allium combinado com o plastoma e dados morfológicos e citológicos. A equipe espera que este estudo possa contribuir para uma análise mais aprofundada de Allium para outros pesquisadores.