A poliploidia, a duplicação de genomas inteiros, é uma importante força evolutiva que prevalece especialmente nas plantas. Um estudo recente revelou que todas as angiospermas passaram por pelo menos duas rodadas de duplicação antiga de todo o genoma, além de vários eventos mais jovens específicos da linhagem. Acredita-se que esses eventos tenham sido muito importantes na diversificação evolutiva das plantas com flores.
linho cultivado (usitatissimum) é conhecido por ter sofrido uma duplicação de todo o genoma cerca de 5 a 9 milhões de anos atrás. O objetivo de um estudo recente em Annals of Botany foi investigar se outros eventos de duplicação de todo o genoma ocorreram na história evolutiva do linho cultivado. O conhecimento dessas duplicações de todo o genoma será importante para entender a biologia e a genômica do linho cultivado.
Transcrição de 11 linum espécies foram sequenciadas usando a plataforma Illumina. As leituras curtas foram montadas de novo e o pipeline DupPipe foi usado para procurar assinaturas de eventos de poliploidia da distribuição de idade de parálogos. Além disso, as filogenias de todos os parálogos foram reunidas dentro de uma janela de idade estimada de interesse. Essas filogenias foram avaliadas quanto à evidência de um evento de paleopoliploidia dentro do gênero linum.
Um evento de paleopoliploidia previamente desconhecido que ocorreu 20-40 milhões de anos atrás foi descoberto e mostrou ser específico para um clado dentro linum contendo linho cultivado (L.usitatissimum) e outras espécies principalmente de flores azuis. A conclusão foi apoiada por duas linhas de evidência. Primeiro, uma mudança significativa de inclinação (pico) foi mostrada na distribuição de idade de parálogos que era filogeneticamente restrito e onipresente neste clado. Em segundo lugar, foi recuperado um grande número de filogenias parálogas que são consistentes com um evento de poliploidia ocorrendo dentro desse clado.
Os resultados mostram a utilidade da transcriptômica multiespécie para detectar eventos de duplicação de todo o genoma e demonstram que as múltiplas rodadas de poliploidia foram importantes na formação da história evolutiva do linho. Compreender e caracterizar esses eventos de duplicação de todo o genoma será importante para futuras linum pesquisa.
