Os sistemas radiculares (RS) são excelentes candidatos para contribuir com o desenvolvimento de novas cultivares tolerantes à seca devido a seu papel fundamental na absorção de água e sua plasticidade fenotípica. Modelos funcionais-estruturais do sistema radicular (FSRSM) são capazes de simular numericamente o movimento da água da raiz até a parte aérea. Os ensaios multiambientais in silico resultantes permitem estimar o estresse hídrico sentido pelas culturas em qualquer ambiente.

Em um novo artigo publicado em in silico Plants, Dr. Félicien Meunier da Université catholique de Louvain e colegas apresentam o MAize Root System Hydraulic Architecture soLver (MARSHAL). Esta ferramenta computacional eficiente e amigável combina um modelo de arquitetura de raiz (CRootBox) com algoritmos rápidos e precisos de fluxo de água através de arquiteturas hidráulicas e cálculos de parâmetros em escala de planta.
“Nosso trabalho anterior mostrou que equações precisas de fluxo de água em uma arquitetura hidráulica do sistema radicular forneciam melhor precisão do que os métodos existentes. A implementação disso em um FSRSM existente preencheu a lacuna entre as características locais da raiz e os parâmetros hidráulicos e arquitetônicos aprimorados da planta”, disse Meunier.
Para ilustrar o potencial da ferramenta, os autores geraram arquiteturas hidráulicas de milho contrastadas que compararam com observações arquitetônicas e hidráulicas do sistema radicular. A variabilidade observada dessas características foi bem capturada pelas execuções do conjunto de modelos.
O código MARSHAL é lançado sob uma licença Open-Source e está disponível como:
- um pacote R: https://github.com/MARSHAL-ROOT/marshal (https://doi.org/10.5281/zenodo.2391555)
- um aplicativo da web on-line: https://plantmodelling.shinyapps.io/marshal/ (https://doi.org/10.5281/zenodo.2391249)
- um pipeline RMarkdown: https://github.com/MARSHAL-ROOT/marshal-pipeline (https://doi.org/10.5281/zenodo.2474420)
Todas as informações relevantes podem ser encontradas no site do MARSHAL: https://marshal-root.github.io/27
