Quem tem um smartphone provavelmente possui um rolo de câmera cheio de imagens esperando para serem organizadas. Agora imagine ter milhões de imagens para processar e dados associados para gerenciar, e algumas delas incluem etiquetas escritas à mão, com a mão trêmula, à luz de velas, há mais de 200 anos, por um botânico que mal sabia soletrar. breviauricata… 

A digitalização significa atribuir uma identidade digital a cada espécime: codificar sua origem em código de barras, fotografá-lo e transformar as informações de suas etiquetas em dados facilmente pesquisáveis. Antes da digitalização, grande parte desse material só podia ser explorado plenamente por pessoas que podiam visitar as coleções pessoalmente ou trabalhar diretamente com os especialistas que melhor as conheciam. A digitalização prometeu algo diferente: a oportunidade de tornar os espécimes navegáveis, visíveis e úteis para pesquisadores, estudantes e amantes de plantas em todo o mundo. 

Este desafio assustador se apresentou à equipe de Coleções Digitais dos Jardins Botânicos Reais de Kew, quando eles garantiram a financiamento essencial do DEFRA Em 2021, a equipe digitalizou suas coleções de herbário em apenas quatro anos. No auge do projeto, a equipe estava realizando imagens de cerca de 100,000 espécimes por semana.

Desde 2022, eles codificaram, catalogaram, fotografaram e transcreveram 7.3 milhões de espécimes de herbário e fungário. Após a conclusão do projeto em março deste ano, a Botany One entrevistou a equipe que idealizou essa iniciativa e a levou adiante: Sarah Phillips - Gerente Sênior de Coleções Digitais, Marie-Helene Weech - Gerente Líder de Operações de Digitalização e Laura Green - Gerente de Dados e Imagens. 

Para muitos usuários, a imagem digital se torna o primeiro ponto de acesso à amostra, então a qualidade é fundamental. Como você encontrou o equilíbrio entre alcançar padrões de imagem consistentemente altos e trabalhar dentro do orçamento do projeto?

Verde: O essencial é saber qual o seu objetivo e quais níveis de qualidade você está disposto a aceitar antes de começar. Obviamente, você quer obter imagens de altíssima qualidade, mas, ao mesmo tempo, não quer paralisar o projeto. Já tínhamos padrões gerais definidos durante o projeto Global Types, como capturar imagens a 600 PPI [número de pixels em uma polegada de uma imagem exibida em um monitor de computador]. Recorremos então à... Padrões FADGI e Diretrizes de Metamorfose Adotar uma abordagem mais quantitativa.

Kew optou por usar uma empresa terceirizada para a maior parte da digitalização e transcrição de seus espécimes. Para leitores menos familiarizados com a digitalização de herbários, isso significa capturar tanto uma imagem de alta qualidade do espécime quanto informações importantes de suas etiquetas. Como foi sua experiência trabalhando com um fornecedor terceirizado para a transcrição de dados? 

PhillipsEm projetos de digitalização anteriores, criamos diretrizes muito rígidas sobre o que seria aprovado ou reprovado. Desta vez [devido ao grande número de etiquetas que precisavam ser transcritas], fomos um pouco mais flexíveis. É preciso ter em mente que o transcritor não está fazendo nenhuma interpretação, apenas transcrição literal, então é necessário ser realista quanto ao que se espera dele. Se o texto estiver impresso, ele deve ser capaz de transcrevê-lo como está escrito, mas a caligrafia pode ser complicada. Elaboramos muitas diretrizes para eles e mantivemos um canal de comunicação aberto para que pudessem tirar dúvidas diretamente com nossa equipe, e eles foram muito receptivos. Sabíamos que não seria a versão final perfeita, porque se você quer uma transcrição perfeita, vai levar dez vezes mais tempo. Pode haver muitos campos em branco no campo "país", por exemplo, porque não queríamos que eles fizessem suposições incorretas. Temos planos de preencher gradualmente os dados que não foram totalmente transcritos por outros meios.

WeechEu estava olhando uma planilha de correções de Portal de Dados de Kew que alguém nos enviou esta manhã. Foi muito bom ver que as pessoas estão realmente usando nossos dados e analisando-os corretamente. Fiquei bastante impressionado com a precisão com que os transcritores chegaram às informações corretas. Acho que eles fizeram um ótimo trabalho!

Após a captura das imagens e dos textos das etiquetas, o próximo desafio foi garantir que os dados seguissem os padrões acordados, para que pudessem ser pesquisados, compartilhados e reutilizados. Esta é a parte menos visível da digitalização: transformar milhões de etiquetas individuais de espécimes em dados estruturados que possam ser utilizados em diferentes bases de dados e plataformas globais de biodiversidade. Quais padrões de metadados representaram o maior desafio para o Kew?

Philips: Usamos Arquivo Darwin Core [um padrão comum de dados de biodiversidade que ajuda os registros de espécimes de diferentes instituições a serem compartilhados e compreendidos da mesma maneira] e então temos nossos próprios padrões para o Sistema Integrado de Gestão de Coleções (ICMS), que está alinhado com o DwC-A, mas contém muito mais dados. Também nos alinhamos com a Informação Mínima sobre uma Amostra Digital (MÉDIOSO desafio residia na forma como os dados foram coletados e associados aos campos; isso exigiu várias etapas de formatação e limpeza de dados. Publicamos os dados, cientes dos problemas, mas o Global Biodiversity Information Facility (GBI)GBIF) é bastante eficiente em sinalizar alguns problemas, então recebemos feedback de agregadores e usuários de nossos dados.

WeechEstamos cientes de muitos erros em campos como coordenadas. Nicky Nicolson (O líder de Análise Inteligente de Dados) está analisando o georreferenciamento e a identificação de valores discrepantes, e essa é apenas uma das maneiras pelas quais podemos resolver muitos dos nossos problemas de coordenadas. Em alguns casos, será necessário revisitar os dados visíveis na imagem; de certa forma, encontrar o espécime físico foi a nossa etapa mais limitante.

Isso também significa que a digitalização não termina quando a amostra é fotografada ou transcrita. Alguns erros só se tornam visíveis quando os dados são usados, mapeados ou comparados em escala.

A digitalização de milhões de amostras não é apenas um desafio técnico; também envolve o desenvolvimento de fluxos de trabalho repetíveis para diferentes equipes, tarefas e verificações de qualidade. Qual a importância do planejamento do fluxo de trabalho neste projeto?

PhillipsPrecisávamos expandir nossa equipe muito rapidamente, então revisávamos e ajustávamos os fluxos de trabalho constantemente. Tínhamos fluxos de trabalho especializados para nossas equipes internas e de fornecedores, e eles exigiam muito treinamento e supervisão. Estávamos fazendo isso em uma velocidade e volume que às vezes pareciam um pouco insanos, mas tínhamos muita experiência e uma equipe central forte para construir a partir dela. 

Depois de trabalhar em uma escala tão grande, o projeto mudou a sua perspectiva sobre as próprias coleções? Qual foi a coisa mais surpreendente que você aprendeu ao longo deste projeto?

Weech: Tínhamos muito mais espécimes de Darwin do que eu esperava! Criamos um grupo de bate-papo onde os digitalizadores podiam postar sempre que encontrassem uma coleção de Darwin para avisar a equipe de curadoria. Normalmente, usávamos sempre o mesmo espécime de Darwin para visitas guiadas e exposições, mas agora podíamos exibir uma grande variedade!

VerdeQuantas pessoas estiveram envolvidas neste projeto no final? Vindo de uma equipe tão pequena, onde digitalizávamos coisas em uma escala muito menor, para de repente ter tanta gente trabalhando junta foi meio surreal! Foi nas festas que percebemos quantas pessoas trabalharam juntas para que tudo acontecesse.

Philips: Concordo. Quando você está no meio da situação, pensa em fluxos de trabalho e gestão, mas também precisa gerenciar sua equipe e garantir que todos estejam satisfeitos. Muitas pessoas foram jogadas de cabeça na água, mas sempre conseguimos nos unir para concluir a tarefa. 

A digitalização em massa pode parecer um termo técnico, mas, em essência, este projeto visa abrir as coleções de Kew para mais pessoas. Milhões de espécimes de herbário e fungário – alguns familiares, outros inesperados, alguns ainda precisando de verificação adicional – agora podem ser pesquisados, estudados e conectados de novas maneiras em todos os continentes.

Para os pesquisadores, isso significa acesso mais rápido a registros de espécimes, imagens e dados de etiquetas. Para os amantes de plantas, estudantes, historiadores e curiosos, é uma oportunidade de explorar uma das maiores coleções de história natural do mundo de qualquer lugar. O projeto também demonstra que a digitalização não é uma etapa única e simples: envolve pessoas, fluxos de trabalho, padrões, verificações de qualidade, interpretação e muita resolução de problemas ao longo do processo.

Então, dê uma olhada ao redor. Portal de Dados de KewProcure por uma planta que você conhece, um lugar que você ama ou um colecionador de quem você já ouviu falar. Você pode encontrar um espécime coletado há décadas ou até séculos – agora visível novamente, pesquisável novamente e pronto para fazer parte de novas histórias!

SABER MAIS:

Graves, E., Phillips, S., e Hill, B. (2024) Simplificação dos fluxos de trabalho para a digitalização de novos espécimes de herbário adquiridos: atendendo aos padrões de acreditação de serviços de arquivo em meio à digitalização em massa. Biodiversity Information Science and Standards, 8. Disponível em: https://doi.org/10.3897/biss.8.138737. 

Wright, I., Bowles, B., Murphy, B., Paton, A., Liu, U., Weech, MH, ... & Adcock, J. (2026). Projeto de Digitalização Científica RBG Kew 2026. Experiência de implementação e lições aprendidas. Disponível em: https://doi.org/10.34885/s29k-4z53

Perfil do Escritor Convidado

Magda (ela/dela) é uma ecologista britânica/polonesa que atualmente reside em Londres, Reino Unido. Com formação em ecologia de campo, ela migrou para a digitalização e curadoria de herbários em 2023. Essa trajetória a levou do Jardim Botânico Real de Kew ao Instituto Botânico do Sul de Londres, e ela ingressará no Trinity College Dublin neste outono.

Imagem da capa: Um digitalizador trabalhando em espécimes de palmeiras em caixas, em uma estação de digitalização. Fonte: Magda Upton