Os penótipos de embriões de coníferas clonados podem ser fortemente influenciados por uma série de in vitro fatores e, em alguns casos, a variação clonal pode exceder a encontrada na natureza. de Aderkas et al. estudar embriões de larício híbrido, Larix × marschlinsii, e descobriram que os embriões zigóticos, que amadurecem na escuridão dentro dos cones de sementes, nunca acumulam compostos fenólicos, enquanto os embriões cultivados in vitro (isto é, somáticos) acumulam fenólicos facilmente. Em contraste, a luz tem um efeito negativo no acúmulo de proteínas. Os embriões somáticos que amadurecem na luz acumulam compostos fenólicos como a quercetrina em suas raízes embrionárias, que ficam vermelhas. Os resultados sugerem que um estudo mais aprofundado dos fatores abióticos é necessário para obter uma melhor compreensão dos eventos durante a embriogênese.