Trabalhos recentes sobre a alga verde Haematococcus lacustris descobriu o maior genoma de plastídio já registrado: impressionantes 1.35 Mb (com >90% de DNA não codificante). Em uma revisão recente publicada na AoBP, David R. Smith examina mais de perto esse gigantesco plastoma, comparando-o com outros grandes DNAs de organelas. David primeiro se deparou com o H. lacustris chloroplast genoma ao escanear a mais nova coorte de plastomas e, para sua consternação, descobriu que havia sido escrito em uma revista não revisada por pares que publica rapidamente relatórios curtos sobre novas sequências de cromossomos microbianos. Ele decidiu que o H. lacustris plastoma merecia ser notado e apreciado adequadamente por aqueles na comunidade de pesquisa de cloroplastos, e uma revisão nasceu.

Algas com grandes plastomas
Algas eucarióticas com plastomas gigantes. No sentido horário da esquerda para a direita: Haematococcus lacustris cepa CCMP 3127, que é equivalente a UTEX 2505, a cepa usada para sequenciamento de plastoma (crédito da imagem: National Center for Marine Algae and Microbiota); a alga vermelha rodellophycean unicelular Corynoplastis japonica (crédito da imagem: Sergio Muñoz-Gómez); e a ulvófita unicelular marinha Acetabularia sp. (crédito da imagem: Albert Kok).

Na sua rever, David mostra que o H. lacustris O repertório de codificação de plastídios não é tão incomum quanto se pensava inicialmente, representando um conjunto padrão de rRNAs, tRNAs e genes codificadores de proteínas. Os espaçadores intergênicos são densos com repetições, e é nessas regiões onde residem as respostas potenciais para a fonte dessa expansão genômica extrema. Ao comparar duas cepas estreitamente relacionadas de H. lacustris, David argumenta que a taxa de mutação do DNA plastidial não codificante é alta e contribui para a inflação do plastoma. Com a crescente importância H. lacustris como uma alga industrial, provavelmente muitos dados de sequenciamento chegarão ao GenBank nos próximos meses e anos — música para os ouvidos de David, pois esta unicélula com seu gigantesco plastoma certamente tem muito mais a nos ensinar sobre a evolução do genoma da organela.

Pesquisador destaque

David Smith

David concluiu seu bacharelado na Acadia University na bela Wolfville, Nova Escócia, Canadá, em 2005, e então mudou-se 75 km para Halifax para um PhD em Genética na Dalhousie University (2005–2010), explorando os estranhos e instáveis ​​genomas do verde. algas. Cansado do Oceano Atlântico, ele viajou pelo país até Vancouver para um pós-doutorado no Biodiversity Research Center da University of British Columbia (2011–2013), continuando a estudar a evolução do genoma em algas. Ele começou como professor assistente no Departamento de Biologia da University of Western Ontario em 2013 e foi promovido a Professor Associado em 2018. Seu grupo passa muito tempo refletindo sobre as origens de algas não fotossintéticas (esgotamentos evolutivos). Eles também fazem muito trabalho de redação científica e comunicação científica. Você pode encontrá-los online em http://www.arrogantgenome.com. Fora do laboratório, David gosta de correr maratonas e beber vinho, mas raramente ao mesmo tempo.