Sequenciamento de DNA de alto rendimento no PAG
Sequenciamento de DNA de alto rendimento no PAG

Minha memória permanente do Genoma Vegetal e Animal (#PAG) deste ano não será tanto as palestras, as muitas discussões individuais que tive, nem as quantidades de boa comida no sul da Califórnia. Serão os amontoados de pessoas nos cantos discutindo seriamente o que fazer com gigabases de leituras de sequências curtas de DNA de seu organismo de escolha. Talvez refletindo esse dilúvio de sequência, estou achando extraordinariamente difícil notar uma 'ação' de muitas palestras. Um número surpreendente se apega rigidamente às suas posições publicadas ou, como tuitou Julian Catchen, “PIs cortam e colam seus relatórios de doações em uma palestra em PowerPoint, falando como se fosse uma reunião de departamento”. Apesar de estar altamente conectado e familiarizado com o computador, com um terço do público on-line, o Feed do Twitter (#PAG) de quase 3000 pessoas é mínimo, com poucas pepitas aparecendo.

Olhando para os PAGs anteriores, surgiram princípios de integração em toda a biologia vegetal, cada conferência com uma grande ideia que mudou minha pesquisa ou pensamento. Esta é a 19ª reunião anual e, ao longo dos anos, vimos a semelhança de genes em enormes distâncias filogenéticas; a genômica funcional identifica o propósito de quase todos os genes; novos sistemas de marcadores que fornecem informações sobre a diversidade de culturas e seus parentes silvestres; a ubiquidade da duplicação do genoma inteiro ou eventos de poliploidia fornecendo a base para a evolução das plantas; micro e pequenos RNAs sendo controles críticos; a utilidade dos mapas genéticos na compreensão da diversidade; os navegadores de genoma universal, bancos de dados e ferramentas da web para extrair informações. Depois que os artigos da Science e da Nature são publicados, as ideias impactam uma maioria substancial dos artigos que publicamos na Annals of BotanyEspero que possamos publicar artigos com base em várias das apresentações feitas aqui. Mas, diferentemente dos encontros anteriores, nesta semana estou com dificuldade em identificar quais NOVAS áreas de pesquisa serão abordadas nos resultados apresentados. Aliás, sentado no fundo da sala, me pego mentalmente compondo cartas de "devolução sem revisão": em grande parte de acordo com o que se espera de outras espécies... reconheço a enorme quantidade de trabalho/dados, mas não consigo vislumbrar novos princípios... é essencial que o trabalho aborde questões importantes... Venho a conferências para ouvir sobre trabalhos em andamento ou incompletos, então é algo que espero ver em uma apresentação, mas suspeito que essa crítica permanecerá em alguns artigos onde o trabalho árduo ainda não foi concluído.

É claro que também (principalmente?) participamos de uma conferência pelas discussões individuais, e estas têm sido tão empolgantes como sempre, com muitas ideias novas debatidas, propostas de colaboração e atualizações sobre o trabalho de cada participante. Com o panorama geral dos dados de sequenciamento, espero que estejamos testemunhando uma pausa antes que a verdadeira biologia emerja do sequenciamento genômico completo – ou melhor ainda, será que alguém pode me convencer de que ainda estar me recuperando da gripe suína me transformou em um velho cínico e que estou perdendo a mudança de paradigma?