Mudanças na distribuição e seleção natural por meio de mudanças climáticas passadas são fatores importantes na determinação da estrutura genética de espécies florestais. Kimura et al. usar uma combinação de filogeografia e métodos de modelagem de distribuição de espécies para identificar as respostas de criptoméria japonesa, endêmica do arquipélago japonês, a mudanças climáticas passadas. Eles identificam quatro conjuntos de genes, um dos quais provavelmente foi estabelecido por refúgio enigmático. Um cline de diversidade genética ambíguo ao longo das elevações seria previsto pelo padrão de distribuição e acessibilidade das populações refugiais após o último máximo glacial, sugerindo que múltiplos refúgios e/ou eventos de mistura afetaram a estrutura geral da diversidade genética.