El raps o canola (Brassica napus) é um dos cultivos oleaginosos mais importantes do mundo. A deficiência de fósforo (P) diminui drasticamente a altura da planta e o número de ramas. No entanto, as bases genéticas que controlam a altura e o número de ramas em B. napus em condição de deficiência de fósforo, você será desconhecido. Liu e colaboradores se propõem a buscar genes candidatos para a altura e o número de ramas por meio de um estúdio de associação do genoma (por suas siglas em inglês GWAS, estudo de associação em todo o genoma) y determine haplotipos tolerantes a condiciones reducidas de fósforo.

Canola. Imagem: canva.

Um painel de associação de B. napus foi cultivado em campo com fornecimento de fósforo (P, 0 kg ha-1) e com um suprimento suficiente (P, 40 kg ha-1). Durante 2 anos, registre a altura das plantas e o número de ramas. Se utilizaron mais de 5 milhões de polimorfismos de um solo nucleotídeo (SPNs) para realizar GWAS da altura y número de ramas a das condições contrastantes de fósforo fornecidas.

Um total de 2127 SNPs tuvieron gran associación (P < 6·25 × 10-07) com a altura e o número de ramas nas condições de fósforo. Há uma correlação significativa entre a variação fenotípica e o número de alelos favoráveis ​​dos loci associados aos cromossomos A10 (chrA10 821671) e C08 (chrC08 27999846), o que contribuirá para a melhoria por meio da agregação desses SNPs. Os genes candidatos BnaA10g0929OD y BnaC08g26640D estão associados aos loci chrA10 821671 e chrC08 27999846 respectivamente. A análise de genes candidatos e de haplotipos mostram que as linhas endogámicas de portadores de ATT em BnaA10g0929OHap1 e AAT en BnaC08g26640Hap1 tem uma maior altura em condições com bajo fósforo que as linhas transportadoras de outros alelos.

Esses loci de SNPs atraíram, os alelos e haplotipos favoráveis ​​e as acessões que portam esses alelos e haplotipos serão úteis para a melhoria e obtenção de cultivares de B. napus tolerantes a condições baixas de fósforo.

ARTÍCULO DE INVESTIGAÇÃO

Liu, H., Wang, J., Zhang, B., Yang, X., Hammond, JP, Ding, G., Wang, S., Cai, H., Wang, C., Xu, F., Shi , L., 2021. Estudo de associação genômica disseca o controle genético da altura da planta e do número de ramos em resposta ao estresse de baixo fósforo em Brassica napus. Annals of Botany. https://doi.org/10.1093/aob/mcab115

tradução espanhola por Lorena Marchant