Vandenboschia speciosa é uma espécie de samambaia altamente vulnerável, com um genoma grande (10.5 Gb). Os gametófitos haplóides e os esporófitos diplóides são perenes, podem se reproduzir vegetativamente e certas populações são compostas apenas por gametófitos independentes. Estas características fazem desta samambaia um bom modelo:
- para análise de alto rendimento de DNA de satélite (satDNA) para investigar possíveis tendências evolutivas em características de sequência de satDNA;
- determinar a contribuição relativa de satDNA e outros DNAs repetitivos para seu grande genoma; e
- analisar se o modo de reprodução ou a alternância de fase entre os estágios haploides e diploides de longa duração influencia a abundância ou divergência do satDNA.
Ruiz-Ruano et al. analisaram a fração repetitiva do genoma dessa espécie em três populações diferentes (uma composta apenas por gametófitos independentes) usando sequenciamento Illumina e análise bioinformática com RepeatExplorer e satMiner.
Eles descobriram que satélites mais longos (e mais antigos) em V. speciosa têm maior conteúdo de A+T e evoluíram de outros mais curtos e, em alguns casos, microssatélites foram fonte de novos satDNAs. Curiosamente, o satélite não explica o enorme tamanho do genoma nesta espécie, enquanto os TEs são o principal componente repetitivo do V. speciosa genoma e principalmente contribuir para o seu grande genoma. Eles também descobriram que o modo de reprodução ou alternância de fase entre gametófitos e esporófitos não acarreta acúmulo ou divergência de satélites.
