A base genética subjacente à diversidade de frutas ainda não é totalmente compreendida, pois principalmente espécies modelo não relacionadas foram estudadas. Os cientistas identificaram em Arabidopsis os principais fatores de transcrição que controlam a identidade da válvula (ou seja, FRUITFULL), o desenvolvimento do replum (ou seja, REPLUMLESS) e a diferenciação das zonas de deiscência (ou seja, SHATTERPROOF, INDEHISCENT e ALCATRAZ). Essa rede reguladora de genes em outras plantas com flores é influenciada por eventos de duplicação durante a diversificação das angiospermas.

Análises de expressão dos homólogos de ALCATRAZ, HECATE, REPLUMLESS e SPATULA em quatro espécies de Solanaceae com frutos secos deiscentes e carnosos.
Análises de expressão de homólogos de ALCATRAZ, HECATE, REPLUMLESS e SPATULA em quatro espécies de Solanaceae com frutos secos deiscentes e carnudos. ACTIN foi usado como controle de carga. A expressão de todos os homólogos é mostrada em órgãos florais dissecados, frutos (F1 e F2) e folhas de (A) Brunfelsia australis, (B) Nicotiana obtusifolia, (C) Capsicum annuum 'Black Pearl' e (D) Solanum lycopersicum'MicroTom'. C, carpelos; Fb, broto floral; F1, estágios iniciais do desenvolvimento do fruto; F2, estágios finais do desenvolvimento do fruto; L, folhas; P, pétalas; S, sépalas; St, estames. -C indica a reação de amplificação carregada sem cDNA.

As Solanaceae estão em uma família diferente, mas contêm muitas culturas importantes. Embora muito tenha sido estudado nas Solanaceae, pouco se sabe sobre as transformações de carpelo em fruto e os fundamentos genéticos de frutos secos deiscentes, frutos que se abrem na maturidade. A maioria dos principais genes reguladores do desenvolvimento de frutos identificados em Arabidopsis também foram estudados em tomate. Ortiz-Ramírez e colegas tiveram como objetivo caracterizar genes candidatos ao desenvolvimento de frutos em Solanaceae e compará-los com os de Brassicaceae. Eles avaliaram a rede reguladora genética em bagas carnosas (Solanum e Pimento) versus cápsula seca (Brunfélsia e Nicotiana) espécies frutíferas, compartilhando um ancestral comum. Os membros de Solanaceae exibem uma ampla variedade de características anatômicas subjacentes a frutas secas e carnudas, bem como um conjunto de ferramentas genéticas únicas para o desenvolvimento de frutas como resultado de eventos independentes de duplicação de genes.

A jusante FRUITFULL-SHATTERPROOF, os genes ALCATRAZ/SPATULA e REPLUMLESS são regulados diferencialmente em espécies com bagas e cápsulas. O estudo retrata um cenário genético mais complexo para o padrão de carpelos e frutos nas Solanaceae do que o sugerido anteriormente. Os autores descobriram que as Solanaceae teriam muito mais redundância genética quando comparadas às Brassicaceae em todas as linhagens gênicas envolvidas na padronização do gineceu e no desenvolvimento do fruto, com exceção dos genes SHP, que são duplicados em Brassicaceae e são de cópia única em Solanaceae.