Lolium perenne (Azevém perene) é a forrageira e espécie de gramíneas mais amplamente cultivada em áreas temperadas em todo o mundo e há uma necessidade de entender as arquiteturas genéticas das principais características agrícolas e características das culturas que fornecem serviços ambientais mais amplos. Harper et al. teve como objetivo identificar regiões genômicas associadas a características importantes para a agricultura, integrando um mapa físico baseado em cromossomo artificial bacteriano (BAC) com um estudo de associação ampla do genoma (GWAS).
Entre ~ 3600 e 7500 contigs de mapas físicos foram derivados, dependendo do software e dos limites de probabilidade usados, e integrados com ~ 35 k clones BAC sequenciados para desenvolver um recurso previsto para abranger a maioria dos L. perene genoma. A partir do GWAS, oito loci diferentes foram significativamente associados com data de cabeçalho, largura da planta, biomassa da planta e acúmulo de carboidratos solúveis em água, sete dos quais podem ser associados com contigs do mapa físico. Isso permitiu a identificação de vários genes candidatos.
A combinação do recurso de mapeamento físico com o GWAS nos permitiu estender a busca por genes candidatos em regiões maiores do L. perene genoma e identificou uma série de anotações de modelos de genes interessantes. Esses mapas físicos ajudarão na validação de futuras montagens baseadas em sequência do L. perene genoma.
