O método da AoBP Prêmios ECOS celebram os pesquisadores que dedicaram esforços consideráveis ao avanço dos objetivos e ideais da ciência aberta. Hoje focamos nas conquistas de Larry Iorque (Noble Research Institute), um dos três ganhadores do Prêmio ECOS 2020. Larry impressionou o painel de jurados como um verdadeiro defensor da ciência aberta com um histórico exemplar que inclui publicações de acesso aberto, pacotes de software de código aberto e conjuntos de dados disponíveis abertamente. Abaixo você pode ler sobre o trabalho de Larry e como ele sente que seu prêmio ECOS ajudará a incentivar a ciência aberta em sua instituição.
Paixão por compartilhar conhecimento
Por meio do ensino e da pesquisa aberta, Larry desenvolveu o amor por compartilhar conhecimento com outras pessoas. Parte de seu compromisso com a ciência aberta é impulsionado por uma crença ética de que o conhecimento fortalece e deve ser gratuito para todos, para melhoria pessoal e benefício da sociedade. Larry é extremamente apaixonado por compartilhar conhecimento, especialmente sobre raízes, tanto em sua própria instituição quanto com a comunidade em geral. Ele é muito ativo no Twitter (@LarryMattYork e @RootPhenomics) e executa o @RootBiologyNews conta para facilitar o acesso às informações sobre as raízes das plantas.
Liderando pelo exemplo
Larry espera que o AoBP O prêmio ECOS ajudará a popularizar as práticas de ciência aberta em sua instituição de origem e inspirar outros pesquisadores de plantas a fazer o que puderem para compartilhar manuscritos, dados, código estatístico e software. Liderando pelo exemplo desde que assumiu o comando do laboratório de fenômica raiz no Noble Research Institute, todas as publicações de seu laboratório foram publicadas em acesso aberto, os dados foram disponibilizados online e dois pacotes de software de código aberto foram lançados no GitHub e no Zenodo. Ele também defendeu a adoção de práticas de ciência aberta em sua instituição e co-escreveu uma estrutura para facilitar isso como parte de seu serviço no Comitê de gerenciamento de dados. Larry também organizou e coorganizou vários workshops com foco na fenotipagem de raízes, como um organizado com IPPN na Noble em 2019, e um próximo workshop on-line co-organizado com a Dra. Lindsay Triplett e o Sociedade Americana de Fitopatologia.
Fenômica de raiz de código aberto
Larry está super empolgado com o mais recente projeto de ciência aberta do laboratório de fenômica raiz. O RhizoVision Explorer (acima) é um pacote de software novo, gratuito e de código aberto desenvolvido por biólogos de raízes para quem deseja incluir medições de raízes em seu trabalho (lançamento público previsto para o final de setembro de 2020). Os planos de hardware para seu laboratório Coroa RhizoVision plataforma de fenotipagem também são extensivamente documentados e compartilhados online. O laboratório lançou uma pré-impressão sobre fenotipagem da absorção de nutrientes taxas por raízes, e atualmente está trabalhando em um manuscrito com foco na respiração radicular. Plataformas futuras estão planejadas para imagens de campo e laboratório (como o carrinho de imagem mostrado abaixo).
Links úteis para o trabalho de Larry
Perfil do Larry no Google Acadêmico
Site do Noble Institute Root Phenomics Lab
Twitter do laboratório de fenômica raiz
Perfil do pesquisador
Larry cresceu no sudeste de Kentucky, aninhado na Floresta Nacional Daniel Boone, e completou sua graduação em biologia na Universidade de Kentucky em 2006. No final de seu programa de graduação, ele se interessou por um problema de modelagem ecológica envolvendo interações de raízes e tem apaixonado pela biologia radicular desde então. Ele concluiu seu doutorado em ecologia pela Universidade Estadual da Pensilvânia em 2014. Sua pesquisa de dissertação concentrou-se nas interações da arquitetura do sistema radicular do milho, fisiologia e ambiente para absorção de nitrogênio. Ele completou cargos de pós-doutorado na University of Nottingham e na University of Missouri antes de ingressar no corpo docente do Noble Research Institute, uma organização de pesquisa agrícola sem fins lucrativos, em 2017. Lá, ele estabeleceu o laboratório de fenômica raiz, onde o trabalho atual se concentra em estudos completos. arquitetura e fisiologia da planta com emprego ativo do pipeline de fenômica funcional, especialmente no que diz respeito à otimização dos orçamentos de carbono raiz e capacidade de absorção. Os planos futuros incluem estudar mais sobre os papéis que as raízes desempenham na saúde do solo e até mesmo transferir o software desenvolvido para fenotipagem de plantas para a fenotipagem do solo.
